Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SKIDA1Q1XH10 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIDA1Q1XH10 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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