Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2SQ16763 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2SQ16763 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms