Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FSCN1Q16658 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FSCN1Q16658 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms