Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRF1Q16656 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRF1Q16656 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms