Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NREPQ16612 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NREPQ16612 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NREPQ16612 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NREPQ16612 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NREPQ16612 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NREPQ16612 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms