Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF239Q16600 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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