Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SGCAQ16586 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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