Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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RPE65Q16518 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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RPE65Q16518 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RPE65Q16518 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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