Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMA4Q16363 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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