Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms