Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USF2Q15853 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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USF2Q15853 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USF2Q15853 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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USF2Q15853 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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