Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCOA1Q15788 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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NCOA1Q15788 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
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NCOA1Q15788 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
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NCOA1Q15788 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NCOA1Q15788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NCOA1Q15788 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
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