Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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EFNB3Q15768 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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EFNB3Q15768 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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EFNB3Q15768 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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EFNB3Q15768 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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EFNB3Q15768 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EFNB3Q15768 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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