Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3CQ15386 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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