Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTPRRQ15256 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRRQ15256 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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