Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD1Q15011 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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