Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHPRHQ149N8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHPRHQ149N8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms