Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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