Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MDC1Q14676 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms