Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF235Q14590 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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