Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEMA3AQ14563 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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