Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms