Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SPIDRQ14159 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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SPIDRQ14159 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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