Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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