Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2H3Q13889 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms