Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms