Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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