Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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CUL3Q13618 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL3Q13618 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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