Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAMK2BQ13554 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms