Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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