Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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