Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SP140Q13342 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SP140Q13342 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SP140Q13342 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SP140Q13342 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SP140Q13342 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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