Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms