Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDRQ13258 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGDRQ13258 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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