Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPS1Q13098 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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