Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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