Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HSPB3Q12988 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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