Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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