Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREBF2Q12772 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
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