Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD300CQ08708 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CD300CQ08708 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms