Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN11Q06124 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN11Q06124 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms