Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms