Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms