Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms