Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NHLH2Q02577 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms