Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
OTUD4Q01804 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms