Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTBSQ01459 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTBSQ01459 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms