Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms