Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF9Q00978 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms