Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms